周二晚上九点出头,陆远洲刚把常师傅的介入预约单签完字,电脑右下角弹出一封新邮件。
发件人elena,标题是“renal
radiomics
manuscript
—
full
draft
v1。0”。
他点开附件,四十七页的pdf文档在屏幕上铺开,五张主图三张补充图,参考文献列了九十二篇,格式已经按《radiology》的模板排得整整齐齐。
陆远洲倒了杯温水搁在手边,从introduction开始逐段往下读。
elena的写作功底不差,开篇从实体器官影像组学的发展脉络切入,把过去十年的核心文献串了一遍,逻辑清晰。materials部分重点写了三个中心的数据标准化流程,包括体模校准、灰度响应矫正和层厚归一化,基本把开源工具包的核心模块都覆盖到了。
results是全文的重头戏,auc
0。85、配准精度92%两个核心数据摆在最前面,配了roc曲线和bland-altman图,视觉效果很直观。discussion写得中规中矩,强调了通用框架对不同器官的适配价值。
整体框架完整,但细节上的毛病不少。
陆远洲切到word版本,打开批注模式,从第一页开始逐行标记。
数据表格里只有总体auc,没有按肿瘤分期做亚组分析,审稿人看到肯定会问。methods里预处理模块的参数描述太笼统,层厚插值用的是三次样条还是线性?窗宽窗位的标准化区间是多少?都没写清楚。discussion部分跟既往文献的对比几乎是空白的,等于自说自话。局限性那一段只提了样本量偏小,没提单中心回顾性设计这个硬伤。
两个小时,三十八条批注。
他把标注好的文档保存,附了封简短的邮件发回去:“初稿框架完整,细节需要打磨。附件是我的修改意见,明晚十点视频讨论。”
发完邮件已经快十一点了。陆远洲站起来活动了下脖子,瞥了眼白板上密密麻麻的待办事项,关灯下班。
次日晚上十点整,视频接通。
elena坐在办公室里,背后是斯坦福医学院标志性的红砖墙,桌上摊着打印出来的批注稿,上面用荧光笔画了好几种颜色。
“陆,你的三十八条意见我全看了。”elena推了推眼镜,语速比平时快不少,“大部分我同意,但有几个点想跟你商量。”
“说。”
“亚组分析这个,我当然知道审稿人会问。但问题是早期肾癌的样本量不够,t1期只有七十八例,单独拿出来跑统计效能不足,p值大概率过不了0。05。”
陆远洲端着水杯想了两秒:“不用单独跑t1。把t1和t2合并成早期组,t3和t4合并成晚期组,这样样本量够用,临床意义也说得通。审稿人要看的不是你每个分期都跑一遍,而是模型在不同疾病阶段的表现有没有差异。”
elena在那头停顿了一下,翻了翻手边的数据表,眼睛亮了。
“这样的话早期组有一百四十一例,晚期组八十六例,确实够了。我这周把分析补上。”
“预处理参数的问题,我让林小禾把代码注释整理一份完整版发给你,直接引用就行。”陆远洲转头看了眼旁边正在敲键盘的林小禾,“今晚能整理完吗?”
林小禾头也没抬:“明天中午之前给您。”
“明天中午之前。”陆远洲把话转回屏幕那头。
elena点头记下,又翻到discussion那部分。两人就文献对比和局限性描述来回讨论了二十多分钟,基本把主要问题都捋顺了。
话题转到作者排序的时候,elena倒是很干脆。
“我一作,你通讯,这个没异议。林小禾和我的博士生方子墨并列二作,你觉得怎么样?”
“方子墨那个空腔器官分割模块的改进做得不错,署名没问题。”陆远洲顿了一下,“不过他是你的学生,你跟他确认一下贡献声明怎么写,别留隐患。”
“放心,我会处理好。”
elena又问了句投稿时间。