下午四点,林小禾把一份打印好的校验报告摆在陆远洲桌上,旁边还放了杯刚泡的茶。
“贿赂?”陆远洲瞄了一眼茶杯。
“汇报。”林小禾面不改色,“梅奥八百四十七例数据传输全部完成,di格式没问题,层厚统一毫米,标注框架跟咱们的兼容,转换工作量不大。”
陆远洲翻开报告,前几页是格式校验的汇总表,干净利落,一目了然。
他对林小禾的做事风格很放心,她该仔细的地方绝不含糊。
翻到第七页,他停下来了。
“十四例标注不一致”几个字被林小禾用黄色荧光笔圈了出来,后面跟着一张详细的对照表。左边是病理报告的分期,右边是影像标注的分期,中间拉了条红线连着。
七例病理写的是pretext
ii期,影像标注却写成了iii期。另外七例的随访终点日期格式混乱,月和日反了。
“日期那七例好解决,格式转换的事。”林小禾先把简单的说了,“麻烦的是前面七例。”
陆远洲抬头看她。“录入错误?”
林小禾摇头。
“我一开始也这么想的,但逐例比对了di元数据里的时间戳和标注版本号之后,发现不对。”
她从旁边抽出另一张纸,上面密密麻麻标着编号和日期。
“这十四例全部集中在1995年以前入组。”
陆远洲放下报告,靠回椅背。“分期标准改版。”
林小禾点头,语气里带着点被抢答的不甘心。
“1996年,pretext分期标准做了一次修订。旧版里划为ii期的一部分病例,在新版标准下会被重新归到iii期。这七例刚好卡在新旧标准的交界地带。”19
“病理报告是当年出的,用的旧版。影像标注是后来补录的,用的新版。两边对不上,但其实都没错。”
陆远洲重新拿起报告,把七例编号挨个看了一遍。
的确,全是1993到1995年入组的老病例。
“你怎么确认不是标注员手滑?”
林小禾早有准备,从电脑上调出一张截图推过来。
“每例di文件的元数据里都有标注软件版本号。这七例用的标注工具是1994年版本,但分期字段填的是1996年修订后的编码。说明有人在1996年以后对旧数据做过一次批量更新,但更新的时候只改了影像标注,没有同步回溯病理报告。”
陆远洲看完截图,把报告合上。
“所以不是数据质量问题,是版本迭代的遗留问题。”
“对。”
这个结论很重要。如果是数据质量问题,整批八百四十七例的可信度都要打折扣。但如果只是分期标准改版导致的映射偏差,修正起来就简单多了。
“映射规则写了没有?”
林小禾又抽出一份文档。四页纸,左边旧版标准,右边新版标准,中间是逐条对应关系。十四例中每一例的具体变动都标得清清楚楚,附着di元数据的截图。
陆远洲从头看到尾,在第二页和第三页各画了个红圈。
“这两处表述改一下。‘可能对应’改成‘根据修订标准明确对应’,别给人留模糊空间。”
他又翻回第四页。
“加一列。”
“什么列?”
“‘转换后是否影响模型输入特征’。分期标准变了,如果输入模型的特征矩阵不受影响,那这十四例直接按新标准统一就行。如果影响了,得单独处理。”
林小禾拿笔记下来,转身回到电脑前开始改。
四十分钟后,修订版文档发给了michael
chen。