当天晚上碰头会,陆远洲把两份审稿意见打印出来摊在桌上。
林小禾看完reviewer
2的大修意见,脸色变了。
“这人不好对付。”
“嗯。但他问的是正经问题,不是故意刁难。”陆远洲指着第二条,“标注一致性这个,我来解决。你负责第一条的替代方案。”
“怎么替代?”
“bootstrap重抽样,1000次迭代,算95%置信区间。现有数据跑一遍,结果放进修回信里当补充证据。”
林小禾想了想:“这个我能做,两天够。但第一条他要的是前瞻性队列,bootstrap只是统计手段,能糊弄过去吗?”
“不是糊弄。”陆远洲拿笔在纸上画了条线,“修回信里明确写“前瞻性验证队列已在本中心启动入组,将在后续研究中独立报告”。这句话是事实咱们确实已经在前瞻性收集了。然后用bootstrap结果作为现阶段的补充支撑,证明现有数据的稳健性。”
“审稿人会买账吗?”
“他要的是态度和证据,不是让你两周内凭空变出一个前瞻性研究。编辑也不会这么不讲道理。”
林小禾点了点头,在笔记本上记下任务。
“那标注一致性呢?你打算怎么做?”
“找两个人,跟我一起各自独立标注同一批影像,互不通气。标完以后你算组内相关系数。”
“谁?”
“张明辉一个。另一个我找附属一院放射科的人。”
林小禾嘴巴张了张:“张明辉?他会标吗?”
“教他。标注不需要会写代码,只需要会看ct。他看了一年的肝脏影像,画感兴趣区域(roi)没问题。”
“行吧。”林小禾合上本子,“那我今晚先把bootstrap的脚本写了。”
“去。”
第二天一早,陆远洲在更衣室堵住张明辉。
“帮我个忙。”
张明辉一边系手术裤腰带一边回头:“说。”
“独立标注20例ct影像的肿瘤边界。我给你教程和软件,一周内完成。”
“为啥?”
“审稿人要多人标注一致性的数据。你是我手术组的一助,天天看肝脏ct,你来标最合适。”
张明辉歪着头想了想:“我标的结果不会拖你后腿吧?”
“不会。标注本身没有对错,要的是独立性和一致性。你按你自己的判断标就行,别问我怎么标的。”
“你跟另一个人也不互相看?”
“对。三个人互盲。”
张明辉点头:“行。你把软件装我电脑上,我每天抽一小时搞。”
同一天下午,陆远洲拨了个电话给附属一院放射科的王副主任。这人是他之前轮转期间认识的,对影像组学有兴趣,人也靠谱。
电话里三分钟说清楚需求。
王副主任爽快答应:“二十例不多,我下班后标,一周怎么样?”
“够了。数据我加密发你邮箱,标完原路传回。”
“没问题。”
分工落定,陆远洲回到工作间把时间线写在白板上:
第1-7天:三人独立标注。
第1-7天:三人独立标注。
第7天:林小禾计算组内相关系数(icc)。
第8-10天:撰写修回信。
第11-12天:通读校对,提交。
两周,卡得刚刚好。
标注的七天里,陆远洲每天早上查完房就钻进工作间,对着屏幕一例一例画roi。每例耗时十五到二十分钟,不算快但够仔细。
张明辉那边进度稍慢,第三天来找陆远洲问了一个操作问题软件里橡皮擦工具找不到在哪。
陆远洲给他指了位置。
“就这?”张明辉瞪眼,“我找了半小时。”
“右上角第二排第三个。”
“我是不是眼瞎?”
“嗯。”
张明辉骂骂咧咧走了。
除此之外,三个人没有任何关于标注内容的交流。
第七天晚上,三份标注数据汇集到林小禾手里。
他导入统计软件,跑icc。
结果出来的时候,林小禾吹了声口哨。
“0。91。”
陆远洲正在旁边写修回信的开头段落,头也没抬。