无奈之下，何腾蛟只带了三十名随从吏卒，轻装简从，冒险北上，去寻找行踪不定的李赤心部。

他一路追索，从衡州追到湘潭。

当他满怀希望地进入湘潭城时，却发现这里已是一座空城――李赤心部并未在此停留，早已东撤。

何腾蛟悲从中来，忍不住放声痛哭。

“五年督师，心血呕尽，而所成竟如是，天也！”

五年督师生涯，呕心沥血，耗尽心血，最终得到的竟是这样的结果，这是天意吗？！

这哭声里，有壮志未酬的悲愤，有心血白流的痛惜，有对同僚掣肘的无奈，更有对大局崩坏的绝望。

痛哭之后，何腾蛟做出了一个令人意外的决定。

他没有立刻撤离这座危险的空城，反而“绯衣冠带坐堂上”。

马进忠得知督师竟然轻身涉险，独入空城，急忙派部将率兵追赶保护。

但一切，都已经太迟了。

清军很快得知了何腾蛟孤身进入湘潭空城的消息。

负责此事的是降将徐勇，而他，曾是何腾蛟的旧部。

此时已降清的徐勇，率轻骑突入湘潭，果然见到了正襟危坐，仿佛在等待他们的何腾蛟。

面对昔日旧主，徐勇心情复杂，他率领部下“罗拜”（环绕跪拜）。

何腾蛟却厉声斥骂徐勇的变节行径，严词拒绝投降。

劝降无效，徐勇无奈，只能命人将其强行带走。

在随后的日子里，清方多次派人劝降。

面对威逼利诱，何腾蛟的回答简单而决绝。

“何惜一剑乎？”――为何吝啬一剑，不快快杀了我？

清军见他不为所动，又使出更卑劣的一招，以其在贵州黎平的家眷性命相威胁。

何腾蛟在回信中写的明明白白。

“为天下者不顾其家，为名节者不顾其身。”

而后他开始绝食，一连七天不吃东西。

他曾对寺院里的僧人说：“舀一瓢河水给我喝。这河水从衡州流来，就好比是我故主辖地的水。我喝下去洗净五脏六腑再离世，也就死而无憾了。”

在何腾蛟的坚决抵抗下，清军无计可施，最终只能将其杀害。

《永历实录》载：何腾蛟临刑前，“举手拍地，连呼可惜！两掌皆碎”。

《野史无文》载。

“所居有神鱼井，井故无鱼也。腾蛟生，鱼忽满井，皆五色。腾蛟遇害，井鱼亦空。”

《黎平府志》载。

“何腾蛟生，一鱼从（井底）洞中游出，乡人捞回家中油煎，半边焦黄而不死。正欲翻面，鱼在锅中翻滚，井水猛涨作浪。乡民惊恐，将鱼放回井中……腾蛟卒，鱼遂隐。”

何腾蛟殉国后，井中五色鱼神秘消失。

这个传说在民间流传甚广，至今黎平县城仍保留有“神鱼井”古迹，供人瞻仰。

永历帝听闻何腾蛟的死讯后后哀恸不已，追赠中湘王，谥“文烈”，并赐祭九坛。

康熙十四年，清廷追赠何腾蛟谥号“忠庄”，并批准将其遗骨从湘潭迁葬至贵州黎平县城附近的西佛崖，同时在神鱼井右侧建祠祭祀。

乾隆四十一年，清廷大规模追谥前明殉节忠臣。

何腾蛟，谥号“忠诚”。_c